在1月8日召开的2009年全国卫生工作会议上，卫生部部长陈竺指出，面对国内外经济社会复杂多变的形势，中央作出了保增长、扩内需、调结构、促改革、重民生的一系列重大决策。当前，做好卫生工作的意义尤为重大，任务尤为艰巨，必须全面分析把握形势，善于从变化中捕捉机遇，勇于开拓进取。卫生部门一定要在党中央、国务院的坚强领导下，依靠各级干部的真抓实干，依靠广大卫生人员的辛勤工作，依靠社会各方面的合力支持，扎实做好各项卫生工作。
    一是按照中央的要求，做好食品安全综合协调工作。各地按照党中央、国务院的要求，要进一步明确职责，理清思路，落实责任，以落实《乳品质量安全监督管理条例》规定的综合协调机制入手，加强食品安全监管的稽查工作，建立先发制人的食品安全体系，系统而有序地解决食品安全问题。
    二是继续加强卫生应急建设，做好地震灾区卫生防疫和恢复重建工作。进一步加强卫生应急机制、体制、法制、预案体系和卫生应急管理体系建设，抓紧编制突发公共事件卫生应急体系和发展规划，强化卫生应急工作的常态管理，建立长效应急机制。依据《汶川地震灾后恢复重建总体规划》，认真做好汶川地震灾区卫生防疫和恢复重建工作。
    三是加强药品监管，促进中医药事业发展。药品监管工作要坚持标本兼治、着力治本的原则，大力抓法制、抓源头、抓标准、抓监管，深化药品专项整治。要加强法规制度建设。推进药品监管法律法规制修订，完善全过程的质量管理规范。要提高各项标准，继续加快实施国家药品标准提高行动计划，优先提高国家基本药物的标准，加快药典标准的制修订工作，完善高风险医疗器械标准。要严格源头监管和全过程监管，强化药品和医疗器械原辅料管理，严控过程质量，严查安全风险，严厉打击药品生产经营领域的各种违法犯罪活动。要完善监管体系，稳妥推进食品药品监管体制改革，保持工作稳定性和连续性，积极推进地方政府食品药品安全责任的落实。要加快投入，继续完善行政监督和技术监督体系。
    进一步完善并出台扶持中医药事业发展的政策措施，进一步健全中医药管理体系。加强中医药发展战略规划的研究制定。贯彻落实中西医并重的方针，注重中医与西医、中药与西药的统筹协调，努力做好中西医结合工作，充分发挥中医药在公共卫生、基本医疗以及重大、疑难疾病防治方面的作用。继续实施培养名医、创建名科、建设名院和中医药进农村、进社区、进家庭的“三名三进”工程，积极推进基层中医药服务网络建设，加强基层中医药人才队伍建设。加快中医临床研究基地建设，加大中医药科研和人才培养力度，集中优势力量开展联合攻关，努力提高中医临床疗效和服务能力。继续实施中医“治未病”工程，探索建立和完善融预防、养生、保健、康复为一体的中医保健服务体系，继续深入开展“中医中药中国行”活动，推进中医药科学普及和文化建设。
    四是加强行风和反腐倡廉建设，构建和谐医患关系。认真贯彻落实中央《建立健全惩治和预防腐败体系2008—2012年工作规划》，坚持标本兼治、综合治理、惩防并举、注重预防的方针，把行风建设和反腐倡廉建设摆到更加重要的位置，使深化医药卫生体制改革与卫生系统反腐倡廉工作同步推进、相互促进。加强医德医风和反腐倡廉教育，深化公立医疗机构人事与收入分配制度改革，完善医疗服务行为管理制度和规范，全面推进医德考评制度。继续深入开展创建“平安医院”活动，维护医疗机构正常工作秩序和患者就医环境。
    五是加强卫生基础性工作，统筹兼顾做好其它各项工作。加强公共卫生监管，加强卫生立法、科技、教育、人才培训和新闻宣传等基础性工作。高度重视和加强卫生信息化建设。高度重视卫生舆论宣传工作。认真研究制订中长期卫生发展规划，启动“十二五”卫生发展规划和专项规划的制订准备工作。积极参与世界卫生组织等国际性、区域性组织的活动。
    六是着力提高做好卫生工作的能力和水平。卫生改革发展的新形势新任务，要求进一步加强和改善各级卫生行政部门对卫生工作的领导，不断提高各级卫生领导干部的能力和水平。当前，卫生工作头绪多、任务重。面对新情况新问题，一要管方向、管大事。各级卫生部门领导干部要站在全局和战略的高度，要想大事、谋大事、办大事，紧紧抓住改革中的关键，着力解决突出问题，在解决管理体制、以药补医机制等方面改革上取得突破。二要抓贯彻、抓落实。各地卫生部门干部要紧密结合本地实际，创造性地开展工作，组织好各类改革试点，切实把医改措施和工作措施不折不扣地贯彻到基层。三要抓管理、抓监督。要从维护和保障人民健康的需要出发，针对突出问题，科学确定资金投入方向，选好项目，把资金用到刀刃上。要严格按照规划要求，制定标准规范，遵守财经纪律，保证资金使用的安全、合规和有效。